אגף התכנון מרכז את כל היעדים והמטרות של העירייה והופכם לתכניות המאפשרות יישום בטווח הקרוב והעתידי.
האגף מטפל בתכניות מתאר מחוזיות וארציות הנוגעות לקרית אונו, מנחה ומאשר תכניות לשכונות החדשות בעיר ומכין תכניות נקודתיות למתחמים שונים כגון מרכז העיר, קרית החינוך וכו'. אגף התכנון פועל למען פיתוח העיר, דואג למיקום השרותים החברתיים והציבורים בפיזור מתאים ומקפיד על רמת העיצוב הסביבתי ואיכות הבניה. האגף גם שותף עם האגפים האחרים בתכנון מערכות התשתית ועיצוב הנוף.
מהנדס העיר הוא הסמכות החוקית לאישור כל העבודות ההנדסיות המתבצעות בעיר והכוללות בניה, סלילה, פיתוח ותשתיות.
בתוקף תפקידו אחראי מהנדס העיר על פעולות הועדה המקומית לתכנון ובניה אשר דנה ומאשרת את התכניות השונות המוגשות לה ומוציאה היתרי בניה.